很久很久以前，在《口袋精灵2》的玛亚大陆里住着一位善良，美丽的女孩。村子里的亲人们为女孩找过许多好男孩，但是女孩都一口拒绝了。因为她觉得要配上她，还得爱护她的宠物美杜莎，但无一例外，每个人都不喜欢美杜莎的样子。村子里的人都认为蛇是很不吉祥的东西，是恶魔的化身。
日复一日，精灵的世界里容不下女孩与邪恶的蛇为伴。尽管有许多男人对女孩许下诺言，讲述如何美好的未来，更有甚者，立下誓言，如果不爱她会受到上帝的处罚。可是，人们并不知道女孩与美杜莎之间拥有心灵交流的能力。她知道面前的男人们都是想要夺得美杜莎，去争夺世界霸主的地位。因为美杜莎有着石化敌人的能力，并且还拥有回血的神力。贪欲让人迷失理智，于是有些男人见女孩不同意，就会用力量迫害她，幸好美杜莎能让女孩逃过劫难。
于是，女孩决定去传说中的新大陆寻找一位真正爱自己，不求名利的男孩。时光飞逝，女孩几乎踏遍了整个玛亚大陆。她与波姆交过手，还看过《口袋精灵2》中最美丽的景色，雪羽凤凰居住的森林，每一块树叶都包裹着份份暖意。有时候女孩还是很怀恋妖精森林的热情，那是和黄金鸟BOSS打架的日子了，常常揪它的羽毛，然后黄金鸟总会啄她。
当女孩在新大陆游历了1年后，女孩依然找不到心中的四叶草。不过她遇见了善良的天神信*安吉。信*安吉是一只可爱却拥有异能的宠物，女孩一眼就喜欢上了这个小家伙。不过，在收服了信安吉后，美杜莎与信安吉常常争着撒娇，女孩为此颇为头疼，不过这份美好却是最难得的真情。
日子消逝，朱颜未老心已老，女孩失望了，她发现世人总是有着各种私心杂念，欲望一刻也没停止过。只有宠物们的单纯与真爱是无法变更的！无数次的战斗，无数次的诱惑，女孩终于明了，原来宠物才是自己的幸运四叶草，其他的物事亦只是过眼云烟。
原来，传说中的四叶草是美杜莎与信安吉！
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